明代《本草纲目》则是古代本草按自然属‘性’分类的最高成就，书中采用该方法将1892味‘药’分为60类。-其矿物‘药’的金类主要是金属的单体物质、合金和金属矿石，‘玉’类主要是硅酸盐化合物，石和卤类多是非金属单体及其化合物。每一类中，还大体上将相同元素和化合物集中排列。植物‘药’中的草部，又分山草、芳草、隰草、毒草、蔓草、水草、石草、苔类、杂草9类。各类‘药’物的排列次序也较为科学，如芳草之中当归、芎劳、蘼芜、蛇‘床’、藁本、白芷等依次相随；毒草中大戟、泽漆、甘遂、续随子等列为同类。前者是因为“‘花’实似蛇‘床’”（伞形‘花’序）；后者则是茎叶“折之有白汁……结实一颗三粒相合生”，这正是大戟属植物的主要特征。其对植物的“析族区类”，已孕育着现代科属分类的萌芽。其动物的排列“由微至巨，由贱至贵”，完全符合生物进化的观点。《本草纲目》的分类，领当时世界之先，纲目分明，便于查阅，在国内外产生了巨大的影响。
古代本草中的自然属‘性’分类，基本上是实用‘性’的分类，与现代系统的植（动）物学自然分类，尚有本质上的区别。但这种系统的自然分类，对临‘床’中‘药’学的意义不大，目前主要为‘药’用植物学、中‘药’鉴定学与‘药’材学等学科所采用。
3.功效分类依据‘药’物的主要功效进行‘药’物分类的方法，称为功效分类。中‘药’的功效分类，是以方便临‘床’用‘药’为目的而进行的分类，能够揭示‘药’物防病治病作用的区别和联系，因此成为现代临‘床’中‘药’学分类的主流。中‘药’的功效分类经历了漫长的发展过程，这种思想的萌芽。可以上溯至《神农本草经》，其所谓上品“益气”、“延年”，下品“除寒热邪气”等，无疑是考虑了功效为标准的。陈藏器《本草拾遗》提出‘药’有宣、通、补、泻、轻、重、滑、涩、燥、湿十类，虽然还不是具体的功效，但在功效分类的发展中。迈出了关键的一步。明清时期随着人们对中‘药’功效认识的提高，以功效分类为主的本草逐渐增多。但在当时，‘药’物按功效分类的方法初具雏形，所分列的类别比较粗糙，查阅时仍不够方便。
现代临‘床’中‘药’学一般将‘药’物分为解表‘药’、清热‘药’、泻下‘药’、祛风湿‘药’等，其下再分若干小类（节），如清热‘药’又分清热泻火‘药’、清热燥湿‘药’、清热解毒‘药’、清热凉血‘药’、清虚热‘药’等。
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其一，毒‘药’非“毒”折叠
追溯到远古神农时代，《淮南子.修务训》中这样记载：“神农……尝百草之滋味。水泉之甘苦，令民知所避
就。当此之时，一日而遇七十二毒。”由此，古代把所有治病的‘药’物泛称“毒‘药’”。《素问.异法方宜论》说：“其病生于内，其治宜毒‘药’。”在古人看来，是‘药’三分毒，实际上是指‘药’物的特‘性’；后来才用以专指毒‘性’较大的‘药’物。《医学问答》对此有解释：“夫‘药’本毒‘药’，故神农辨百草谓之‘尝毒。‘药’之治病。无非以毒拔毒，以毒解毒。”医圣张仲景更有‘精’辟之论：“‘药’。谓草、木、虫、鱼、禽、兽之类，以能治病，皆谓之毒”，“大凡可避邪安正者，均可称之为毒‘药’。”神农一日而遇七十二毒，是说他一日之中。辨别了70余种‘药’物的特‘性’。‘药’之特‘性’，用对了可以治病救人，用错了就会伤人害命。
其二，四气疗疾折叠
中‘药’有“气”，“气”是什么？它能治病？的回答都是肯定的。在《神农本草经》中说：“‘药’又有寒、热、温、凉四气。”“疗寒以热‘药’。疗热以寒‘药’。”‘药’之“四气”便由此而来。中医‘药’理论中说到“气”，居然有27个义项。这个“气”，不是日常生活中的概念，而是特指“‘药’‘性’”。的先祖用寒、热、温、凉来诠释‘药’的特‘性’，比“毒”要具体、科学多了，这中‘药’的补，不仅内容丰富，而且别具文化情趣。有补气、补心、补血、补肾、补脾、补肝、补肺、补‘阴’、补阳等等，与之相应的方‘药’有“补心丹、补肝散、补肺散、四物汤、归脾汤、补‘阴’丸、补血荣筋丸、补中益气汤、四君子汤、杞菊地黄丸、六味地黄丸、百合固金汤、补阳还五汤、补肾磁石丸、补肺阿胶汤等等，有以上功能的单味‘药’，不下数十种，举不胜举。此类补法多是补脏气。这个“补”，是调理、增强的意思；这个“气”，是指生理功能，即用‘药’物来调理增强五脏六腑的生理功能，使之发挥正常作用，充分体现中‘药’对人体功能器官治本的作用。《神农本草经》中把‘药’分为上、中、下三品(即“类”)，并说：“上‘药’养命，中‘药’养‘性’，下‘药’治病。”又说：“上‘药’……为君，主养命以应天”，“中‘药’……为臣，主养‘性’以应人”，“下‘药’……为佐使，主治病以应地”。
所谓养命、养‘性’，都是突出了中‘药’调养人体的功效，从而保证机体、各个器官组织的功能正常，这就是许多人信奉中‘药’的原因之一。这是中‘药’学的进步，也是它的特‘色’，这其中也充满了文化意味。中‘药’的这种特‘性’，被一一体现在每一味‘药’中，因为它对于疗疾治病十分重要。对于寒病就要用热‘性’‘药’，对于热病就要用寒‘性’‘药’，这里‘药’‘性’与病‘性’是相逆的，所谓相反相成，这就是‘药’文化的一种具体表现。若非如此，如果“以热益热(用热‘药’治热病，下句仿此)，以寒增寒”，就会导致“‘精’气内伤，不见(现)于外”，这是治疗上的严重失误(《汉书.艺文志.文技略》)。孙思邈在《大医‘精’诚》中严肃地批判了那些“寒而冷之(是寒病，却用寒使病症更寒，下句仿此)，热而温之”的医生，“是重加(即加重)其病”，必导致死亡。中医‘药’学上称这种用‘药’方法为“正治”，即常规治法。还用一种“反治”。
其三，‘药’补趣话折叠
此外，还有味补。《神农本草经》中说：“‘药’有酸、咸、甘、苦、辛五味”。在《素问.宣明五气篇》中讲得明白：“五味所入(即进的器官)：酸入肝、苦入心、甘入脾、辛入肺、咸入肾”。可见‘药’味不同，功效各异，原因是，酸味能收能涩，苦味能泄能燥，甘味能补能缓，辛味能散能行，咸味能软坚润下。根据五味的‘药’用功能与进入相应脏腑的情况，也可以发挥其“补”(或补养、或调理)的作用。
其四，君臣佐使折叠
君臣本是一个政治术语，古代天子、诸侯都称君，辅佐君者称为臣，君臣有着严格的等级之分。古代‘药’学家将它
引入‘药’物配伍组方中，成为方剂组成的基本原则。早在西汉初年成书的《素问.至真要大论》中，岐伯回答黄帝关于“方制君臣”时说：“主病之谓君，佐君之谓臣，应臣之谓使”，《神农本草经》说：“‘药’有君、臣、佐、使，以相宣欇”。明代的何伯斋更进一步阐释说：“大抵‘药’之治病，各有所主，主治者，君也；辅治者，臣也；与君‘药’相反而相助者，佐也；引经使治病之‘药’至病所者，使也”。十分清楚地讲明了君、臣、佐、使之‘药’的功能。更详尽一点说，君‘药’是针对主病或主证，起主要作用的‘药’物，按需要可用一味或几味；臣‘药’是辅助君‘药’加强治疗主病或主证作用的‘药’物，或者是对兼病或兼证起主要治疗作用的‘药’物；佐‘药’是辅助君臣‘药’起治疗作用，或治疗次要症状，或消除(减轻)君、臣‘药’的毒‘性’，或用于反佐‘药’，使‘药’是起引经或调和作用的‘药’物。以《伤寒论》中第一方“麻黄汤”为例，主治外感风寒的表实证。君‘药’——麻黄(3两)，辛温，发汗解表以散风寒，宣发肺气以平喘逆。臣‘药’——桂枝(2两)，辛甘温，温经和营，助麻黄发汗解表。佐‘药’——杏仁(70个)，苦温，降肺气助麻黄平喘。使‘药’——炙甘草(1两)，苦温，调和诸‘药’又制约麻、桂发汗太过。麻、桂、杏皆入肺，有引经之效，故不再用引经的使‘药’。麻黄、桂枝、杏仁、炙甘草的‘药’‘性’有有次，相互制约又相互补充，协调作用，形成一股强大的‘药’力，去攻克外感风寒这一堡垒，临‘床’疗效十分显著，成为千古名方、经方。中‘药’方剂的组成不是几种‘药’物的简单组合，而是在丰富的临‘床’实践基本上形成的一个有机的整体。其中文化内涵的核心就是儒家所强调的“和”,
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